تعمل المؤسسة المصرية للحقوق البيئية لحماية الحقوق البيئية والمناخية للأفراد، وضمان وصولهم الآمن إلى الموارد الطبيعية لضمان حمايتهم، وتعزيز المشاركة الفاعلة للمواطنين في إدارة هذه الموارد لضمان استدامتها، والحفاظ عليها، واحترام حقوق الأجيال اللاحقة.
تكرس المؤسسة جهودها لتعزيز مفهوم العدالة البيئية والمناخية في مصر والمنطقة، بالإضافة إلى إنشاء آلية لرصد الانتهاكات البيئية والمناخية في المنطقة، والمساعدة في معالجة هذه الانتهاكات، سواء من خلال تعديل السياسات والقوانين البيئية والمناخية أو من خلال تبني التقاضي الاستراتيجي لنشر مفاهيم العدالة البيئية والمناخية بين الأطراف الفاعلة الرئيسية في هذه السياسات والقوانين. كذلك تعمل لضمان مشاركة المجتمعات المحلية والنساء في اتخاذ القرارات البيئية والمناخية، بالإضافة إلى توفير الأدوات القانونية المناسبة التي تساعد في المطالبة الفاعلة بالحقوق البيئية والمناخية بطريقة سليمة قانوناً. علاوة على ذلك، تدافع المؤسسة عن المدافعين عن البيئة والمناخ، وتضمن حمايتهم من المقاضاة غير المنصفة، وضغط الشركات المتعددة الجنسيات، والانتقام السياسي، من أجل تمكينهم من الدفاع بفاعلية من دون خوف من الأذى أو الانتقام.
